Après la reproduction, la femelle revient sur le sable pour y construire un solide nid, constitué d'un mélange de terre et de végétaux.
Elle pond ensuite ses oeufs de 20 à 80 en fonction des espèces et les dépose dans le nid. La femelle ne couve pas ses oeufs, mais veille ensuite sans relâche sur la portée, pendant 80 jours sans manger.
Il est vrai que c'est le moment ou le crocodile craint le plus les autres prédateurs. Les oeufs sont tout à fait au goût de nombreux animaux (oiseaux, reptiles, petits mammifères). Le climat (soleil, pluies) peuvent également faire beaucoup de dégâts. Les jeunes crocodiles sont en danger dès l'éclosion
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